目前用于处理养殖场粪污的厌氧工艺很多，其中较为常用的有以下几种：厌氧滤器（AF）、上流式厌氧污泥床（UASB）、复合厌氧反应器（UASB＋AF）、两段厌氧消化法和升流式污泥床反应器（USR）等。
养牛场污水处理设备污水经过固液分离机，去除大部分禽类粪便以及大颗粒悬浮物质；固液分离后污水进入沼气池，进行厌氧发酵，厌氧发酵后产生的沼气用可于生活和生产；厌氧出水，沼液进入初沉池，去除悬浮颗粒物。
可根据养猪场废水水质特性及排水情况，在废水处理工艺前端设置固液分离段，从而使粪便和废水初步分离，以减少废水处理量，一般分离后的猪粪和人工清除的粪便，进行堆放发酵后，可加工作为有机肥出售。
采用循环水养殖模式，通过改造养殖模式，添加合适的水处理设备，使养殖水“动”起来
根据食品加工废水的污染物和特点，常采用物理法和物理化学法的方式作为预处理去除悬浮物、漂浮物以及沉淀物，而生物法主要主导方式去除废水有机物、氨氮以及磷。
生化处理采用A2O法处理工艺。由于废水中有机物浓度较高，且含有大量大分子污染物，直接采用好氧处理会使处理效率偏低。生化处理前段采用厌氧处理工艺
食品加工污水处理系统由调节池、缺氧池、好氧池(接触氧化池)、二沉池组成。来源于加工车间的废水自流入调节池，调节池入口设格栅除污机，以截拦大颗粒和纤维杂质残渣，格栅除污机所截拦的废渣自动进到杂物箱，自动由环境卫生单位清理运送。
鱼制品加工废水先经过格栅去除水中较大的悬浮物进入调节池，调节池的主要作用是均衡水质水量，使系统可以在一个较为稳定的条件下运行。调节池的水采用泵提的方式加入絮凝剂后进入气浮的混合区，与释放后的溶气水混合接触，使絮凝体粘附在细微气泡上，然后进入气浮区。
气浮池出水自流进入水解酸化池进一步进行食品废水处理，水解池内安装填料以截留污泥，在此将大分子不易降解的污染物质，水解为小分子易降解的物质，从而提高了废水的可生化性，为后续好氧提供了良好的反应条件。
物理处理法是指应用物理作用改变废水成分的处理方法。用于食品工业废水处理的物理处理法有筛滤、撇除、调节、沉淀、气浮、离心分离、过滤、微滤等。前五种工艺多用于预处理或一级处理，后三种主要用于深度处理。
